В 3 километрах от Актау находится радиоактивное озеро Кошкар-Ата, в которое на протяжении десятилетий свозились опасные отходы. Площадь этого загрязненного водоема составляет 77 квадратных километров, а общий объем накопленных отходов превышает 150 миллионов тонн, из которых 51,8 миллиона тонн — это урановые отходы. Среди опасных химических веществ, обнаруженных в этих отходах, присутствуют нитраты, металы, а также радионуклиды.
Специалисты подчеркивают, что пиритные отходы, остающиеся от переработки серного колчедана, особенно опасны, так как их частицы могут переноситься на большие расстояния и попадать в организм человека. Об этом говорит ветеран экологической службы Орынбасар Тогжанов, который на протяжении многих лет работал в области охраны окружающей среды. Он также сообщает о проведенных исследованиях с 2003 по 2007 год, которые выявили накопление тяжёлых металлов и радионуклидов в почве, растениях и даже в шерсти домашних животных.
Несмотря на то что с 2007 по 2009 годы были предприняты некоторые меры по обезвреживанию отходов, значительная часть территории остаётся открытой и продолжает загрязнять окружающую среду. В 2017 году был подготовлен проект по обезвреживанию отходов хранилища Кошкар-Ата, однако реализация затянулась на долгие годы из-за бюджетных проблем и судебных разбирательств.
Чтобы предотвратить полное пересыхание озера и выбросы пыли, в котловину начали сбрасывать сточные воды из канализации Актау. С 2014 года в районе озера также высаживают саксаул для формирования зелёного экрана. К настоящему времени высажено уже 124 гектара растений, и планируется высадить ещё 1 миллион саженцев.
Несмотря на усилия, независимые эксперты, такие как эколог Адильбек Козыбак, выражают опасения относительно эффективности проводимых мероприятий и расходования бюджетных средств. В 2021 году начались работы по рекультивации 4279 гектаров, но изначальный объем покрытия почвой был минимальным, что вызывает вопросы о выполнении проекта и контроле за его реализацией. В текущий момент работы приостановлены до завершения дополнительных научных исследований, и общество остается настороженным в отношении дальнейших действий правительства по оздоровлению ситуации с озером Кошкар-Ата.